Είναι σταυροειδής ναός χωρίς τρούλο, παρεκκλήσι της ενορίας Αγίου Νικολάου Χαλέπας. Βρίσκεται στην περιοχή «Φρούδια», στο κέντρο μοναστηριακού συγκροτήματος που είναι παράρτημα της Ιεράς Μονής της Αγ. Τριάδας. Στον ίδιο χώρο κατά την περίοδο της Ενετοκρατίας λειτουργούσε γυναικείο μοναστήρι που καταστράφηκε κατά την κατάληψη του Νησιού από τους Τούρκους.
Το καθολικό του ήταν ο Άγιος Ματθαίος. Η σημερινή εκκλησία χτίστηκε πάνω στα ερείπια της παλιάς στη δεκαετία του 1960. Στον περιβάλλοντα χώρο κτίστηκε οικοτροφείο θηλέων και λίγο αργότερα ορφανοτροφείο. Τα κτίρια αυτά παραχωρήθηκαν από τη Μητρόπολη για τη φιλοξενία της Ιερατικής Σχολής Κρήτης που μεταστεγάστηκε το 1974 στο χώρο αυτό από την Ι.Μ. Αγίας Τριάδας. Σήμερα στεγάζεται το Εκκλησιαστικό Λύκειο Χανίων.